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La Plateforme Rnomique de l'Université de Sherbrooke offre un vaste éventail de services de séquençage de prochaine génération, de RT-PCR, et de bioinformatique à la communauté de recherche au Canada et ailleurs. La plateforme a été créée en 2006.
Nous fournissons un service de séquençage de courtes lectures complet, de la préparation des librairies au stockage et à l'analyse des données, en passant par le séquençage. Nous proposons une gamme de services à moyen et haut débit utilisant les plateformes AvitiTM d'Element Bioscience (jusqu'à 1 milliard de lectures).
Nous offrons des services avancés de séquençage de troisième génération avec la plateforme Oxford Nanopore Technologies. Nos appareils polyvalents nous permettent de personnaliser la profondeur de séquençage, ce qui nous permet de nous adapter aux exigences uniques du projet de chaque client et de fournir un service adapté.
Nous avons développé une plateforme computationnelle et expérimentale automatisée pour les recherches à grande échelle basée sur la RT-PCR. Les applications principales sont pour des études d'expression de gène par PCR par gouttelettes digitales (ddPCR), par RT-PCR quantitative en temps réel (qRT-PCR), et pour l'annotation et l'analyse d'épissage alternatif par RT-PCR en point final couplée avec l'électrophorèse microcapillaire (ASPCR). Nous faisons la conception, l'exécution et l'analyse de milliers de réactions qRT-PCR et ASPCR par jour de façon routinière.
Nous offrons un service flexible et complet de préparation d'échantillon incluant l'isolement de l'ARN et de l'ADN, et le contrôle de la qualité à partir de source provenant de cultures cellulaires ou de tissus. Nous offrons aussi un soutien bioinformatique exhaustif pour la conception expérimentale et l'analyse des données couvrant un large champs d'application.
Les clients peuvent accéder à leurs résultats et à toutes les données expérimentales via un portail Web sécurisé. Le personnel expert de la plateforme est toujours disponible pour consultation directe à toutes les étapes de chaque projet. La plateforme développe continuellement de nouveaux essais et protocoles bioinformatiques pour répondre aux besoins de sa clientèle en expansion, qu'elle soit Université de Sherbrooke, académique canadienne ou externe, ou industrielle.
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