Splice Screen
Une plateforme CRISPR/dCas13Rx unique qui dispose des ARN guides sur l'ensemble d'un transcrit afin de cartographier les éléments régulateurs contrôlant l'épissage, la stabilité et l'expression de l'ARN.
Le Splice Screen CRISPR/dCas13Rx est une plateforme unique de génomique fonctionnelle développée à la Plateforme ARN de Sherbrooke. Elle permet l'interrogation à haut débit des éléments régulateurs de l'ARN directement au niveau du transcrit, révélant les séquences cis-régulatrices qui contrôlent l'épissage, la stabilité et l'expression des transcrits.
Ce que vous pouvez étudier
Interroger la régulation de l'ARN partout où elle se produit, des choix d'épissage à la stabilité des transcrits.
Inclusion et saut d'exons
Identifier les séquences cis-régulatrices qui favorisent ou répriment l'inclusion d'un exon dans votre transcrit.
Rétention d'intron
Détecter les éléments qui contrôlent la rétention d'intron, une couche clé de la régulation post-transcriptionnelle.
Choix de sites d'épissage alternatifs
Cartographier les séquences qui orientent le choix entre sites d'épissage concurrents.
Impact fonctionnel des variants
Déterminer si les variants faux-sens, synonymes ou introniques profonds agissent via le traitement de l'ARN plutôt que sur la séquence protéique seule.
Modulation de l'expression génique
Cibler la 3′UTR et d'autres éléments régulateurs pour moduler la stabilité, la dégradation et la traduction de l'ARN.
Découverte de cibles thérapeutiques
Révéler des cibles candidates pour des interventions à base d'ARN, telles que les oligonucléotides antisens (ASO).
Comment ça fonctionne
Un criblage systématique au niveau du transcrit, de la conception à la carte régulatrice.
Disposer les ARN guides sur le transcrit
Nous disposons systématiquement des ARN guides CRISPR/dCas13Rx sur les exons, introns, UTR et jonctions d'épissage de votre gène d'intérêt.
Perturber au niveau de l'ARN
dCas13Rx agit sur l'ARN cible sans modifier le génome, ce qui permet de sonder la fonction directement au niveau du transcrit.
Lire les effets régulateurs
Des lectures à haut débit quantifient comment chaque guide modifie l'inclusion d'exon, le choix de site d'épissage, la rétention d'intron ou l'abondance du transcrit.
Produire des cartes régulatrices
Le résultat est une carte cis-régulatrice de votre transcrit et une liste restreinte de cibles thérapeutiques candidates.
Pourquoi le Splice Screen
Une solution innovante, évolutive et personnalisable pour la recherche en régulation de l'ARN.
Haut débit
Disposition systématique sur l'ensemble du transcrit en une seule expérience.
Résolution au niveau du transcrit
Lectures fonctionnelles directement au niveau de l'ARN, non déduites de l'ADN ou des protéines.
Sensible aux variants
Disséquer l'impact au niveau de l'ARN des variants faux-sens, synonymes et introniques profonds.
Personnalisable
Conçu autour de votre gène, de vos régions d'intérêt et de votre question biologique.
N'importe quel gène d'intérêt
Applicable à pratiquement n'importe quel transcrit que vous souhaitez comprendre ou manipuler.
Académique et industriel
Une solution évolutive pour la recherche académique comme pour les programmes industriels.
Un transcrit à décoder ?
Indiquez-nous votre gène et votre question, nous concevrons un Splice Screen qui cartographie la régulation de l'ARN qui vous intéresse.